遲到是否扣除全勤獎(jiǎng)金或其他金額，需根據(jù)公司內(nèi)部規(guī)章制度進(jìn)行，并且該制度應(yīng)該由員工確認(rèn)過。根據(jù)相關(guān)規(guī)定因勞動(dòng)者本人原因給用人單位造成經(jīng)濟(jì)損失的，用人單位可按照勞動(dòng)合同的約定要求其賠償經(jīng)濟(jì)損失。經(jīng)濟(jì)損失的賠償，可從勞動(dòng)者本人的工資中扣除。但每月扣除的部分不得超過勞動(dòng)者當(dāng)月工資的20%。若扣除后的剩余工資部分低于當(dāng)?shù)卦伦畹凸べY標(biāo)準(zhǔn)，則按最低工資標(biāo)準(zhǔn)支付。但在實(shí)踐中，部分地區(qū)仲裁與已經(jīng)沒有嚴(yán)格按照20%標(biāo)準(zhǔn)去認(rèn)定，公司并不能當(dāng)然扣發(fā)員工工資。因?yàn)閱T工的過錯(cuò)，造成公司損失，如果公司制定了相應(yīng)的獎(jiǎng)懲制度，并且員工已經(jīng)知曉確認(rèn)，那么公司可以根據(jù)公司制度進(jìn)行處罰，但是公司支付給員工當(dāng)月的工資不能低于當(dāng)?shù)氐淖畹凸べY標(biāo)準(zhǔn)。

法律依據(jù)：《工資支付暫行規(guī)定》第十六條

因勞動(dòng)者本人原因給用人單位造成經(jīng)濟(jì)損失的，用人單位可按照勞動(dòng)合同的約定要求其賠償經(jīng)濟(jì)損失。經(jīng)濟(jì)損失的賠償，可從勞動(dòng)者本人的工資中扣除。但每月扣除的部分不得超過勞動(dòng)者當(dāng)月工資的20%。若扣除后的剩余工資部分低于當(dāng)?shù)卦伦畹凸べY標(biāo)準(zhǔn)，則按最低工資標(biāo)準(zhǔn)支付。