法律分析：不合法。用人單位應(yīng)當(dāng)按照勞動(dòng)合同規(guī)定和國(guó)家規(guī)定，向勞動(dòng)者及時(shí)足額支付勞動(dòng)報(bào)酬，扣一天工資即可。但是，如果員工的曠工行為直接導(dǎo)致公司經(jīng)濟(jì)損失，可以要求賠償，而不能一律規(guī)定為扣工資。公司“曠工一天扣三天工資”規(guī)定違反了《中華人民共和國(guó)勞動(dòng)合同法》第二十六條。

法律依據(jù)：《中華人民共和國(guó)勞動(dòng)合同法》 第二十六條 下列勞動(dòng)合同無(wú)效或者部分無(wú)效：

（一）以欺詐、脅迫的手段或者乘人之危，使對(duì)方在違背真實(shí)意思的情況下訂立或者變更勞動(dòng)合同的；

（二）用人單位免除自己的法定責(zé)任、排除勞動(dòng)者權(quán)利的；

（三）違反法律、行規(guī)強(qiáng)制性規(guī)定的?！薄皶绻ひ惶炜廴旃べY”之規(guī)定明顯免除了用人單位支付勞動(dòng)報(bào)酬的法定責(zé)任、排除了勞動(dòng)者獲取勞動(dòng)報(bào)酬的權(quán)利，應(yīng)屬無(wú)效。擴(kuò)展資料：如果用人單位未及時(shí)足額支付勞動(dòng)報(bào)酬的，勞動(dòng)者是有權(quán)利與公司解除勞動(dòng)合同的，對(duì)于這樣的情況公司還需要額外向勞動(dòng)者支付經(jīng)濟(jì)補(bǔ)償金的，也就是對(duì)于不主張員工權(quán)利的公司，作為勞動(dòng)者是有理由與公司解解除勞動(dòng)合同并獲得賠償?shù)?。在工作生活中遇到了公司以這種名義克扣工資時(shí)，作為勞動(dòng)者，公司如果按照三倍扣除工資，這是不合理的，有理由也有權(quán)利與公司進(jìn)行理論。如協(xié)商不成，建議馬上向當(dāng)?shù)氐膭趧?dòng)行政部門(mén)來(lái)進(jìn)行投訴，由該行政部門(mén)介入查處，堅(jiān)決杜絕這種不合理規(guī)章制度的出現(xiàn)。