南普陀寺是中國古代建筑物之一，大雄寶殿石柱上有副對聯(lián)："經(jīng)始溯唐朝與開元而并古，普光被夏島對太武以增輝。"這副對聯(lián)將寺廟開基的年代和地理位置說得清清楚楚，那就是說寺廟在唐朝就有了，距今也有1200多年;寺廟對著南太武山，真是風(fēng)水寶地。據(jù)說該寺是唐代首先到島上開發(fā)的陳氏族人所建，五代時(shí)，稱泗洲院，宋初叫無盡巖，后該名叫普照寺. 普照院，元代至正年被毀，明洪武時(shí)重建，明末又毀于兵火，清康熙二十三年公元1684年，由統(tǒng)一中國的施瑯將軍重建。因與浙江普陀山普濟(jì)寺同觀音菩薩，又地處普陀山之南，故稱南普陀寺，是目前國內(nèi)僧人較多的寺廟。南普陀寺坐子向午，依山面海，呈中軸線遞次向上，主體建筑有天王殿，鐘鼓樓，大雄寶殿，大悲殿，藏經(jīng)閣，向左右對稱展開，依次層層升高，層次分明，俯仰相應(yīng)。東西二側(cè)依次升高的廡廊，回護(hù)著三殿，形成一個(gè)整體，雄偉壯觀。南普陀寺原為"臨濟(jì)宗"一派世襲主持，起，該為十方叢林選賢制，選撥賢者為方丈。自那時(shí)到至今已選任了11任方丈。

　　南普陀寺改革開放后增加了活力，得到了的扶持，也得到了十方信善的捐贈。80年代以來，所有堂院都翻修一新，還新建了一批設(shè)施，主要有：海會樓. 普照樓. 方丈樓. 太虛圖書館，兩座山門以及閩南佛學(xué)院的教學(xué)樓. 僧舍樓，還有佛教協(xié)會的辦公室. 上客堂，會客樓。1992年在般若池畔，新建了一座氣勢宏偉的大禪堂，堂高三層，八角重檐飛脊，圍以白石雕欄，精巧嚴(yán)密，富貴堂皇?，F(xiàn)在的南普陀寺是建寺以來最為昌盛的時(shí)期，是閩南乃至福建最為流光溢彩，金碧輝煌的寺院!南普陀寺院內(nèi)以及后山五老峰前，都留下歷代許多摩崖石刻和多塊碑記，主要有明太常寺卿林宗載的"飛泉"，清施瑯將軍的"為善最樂"，以及抗荷將軍沈有容等的題刻和光緒三十四年美國艦隊(duì)訪問廈門的刻石，都提供了歷史的見證。